Concluído em 1977, o Batistério ocupa um lugar próprio. É parte anexa em composição subtrativa, e está separado da nave da igreja para não comprometer a pureza e claridade do corpo principal. Tem forma ovóide e paredes revestidas de painéis de lajotas nas cores verde, azul e branca, criados por Athos Bulcão. Conecta-se com a nave por um corredor interno; e com a Praça de Acesso por uma escada helicoidal. Com iluminação indireta e piso forrado de tapetes escuros, mantém um ambiente que convida à reflexão e à contemplação da beleza dos significados de sua função. A pia batismal está colocada bem no centro, em plano mais elevado.